该技术利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团，经高精度质谱仪串联分析，可同时比较多达8种样品之间的蛋白表达量。

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与植物和动物代谢组学相比，微生物在生长培养基中浓度较低，具有低浓度代谢物难于检测，胞内和胞外代谢物不易分离等特点。

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是一种体内标记技术，利用含轻、中或重型同位素标记的必须氨基酸培养基培养细胞来标记细胞内新和成的蛋白质

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多肽指纹图谱系统以MALDI TOF/TOF质谱系统为基础，把样品分离、质谱分析和生物信息学相结合，为差异蛋白的发现提供了新的途径。方案简单、重复性强、通量高，分离低丰度蛋白效果尤其显著。

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ABI 5800 Plus MALDI TOF/TOF™是世界上最畅销的基质辅助激光解离飞行时间质谱系统，测定生物大分子的最大分子量可以达到600kDa，而且具有极高的灵敏度，能够分析fmol级别的蛋

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复杂体系中的多肽、蛋白质混合物的分析与鉴定，有机染料、多糖、聚合物等大分子化合物的分子量快速测定。

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